Bottens est connu sous le nom de Botens en 1142. Bournens forme un fief de l'évêque de Lausanne au XIIe siècle. Le village fait ensuite partie de la châtellenie d'Échallens. Il fait partie du bailliage d'Orbe-Échallens entre 1475 et 1798. Le village est géré par les communiers.