Genthod, durant l'Antiquité, était habité par des Helvètes et des Romains. Au Moyen Âge, Genthod faisait partie du mandement de Peney et dépendait de l'évêque de Genève. En 1328, ce dernier donne des terres à la famille de Genthod, qui possède une maison forte dans le village.